Do głównych zalet stosowania terapii kriochirurgicznej można zaliczyć:
• ogniska kriodestrukcji szybko ulegają gojeniu, w ich miejscu powstają znikome blizny, dzięki czemu osiągany jest dobry i szybki efekt terapeutyczny,
• nie wymaga specjalnych przygotowań pacjenta do zabiegu,
• oddziaływanie kriochirurgiczne w większości przypadków jest bezbolesne i nie wymaga wstępnego znieczulenia,
• zamrażanie zamyka drobne naczynia tętnicze i żylne, co umożliwia przeprowadzanie zabiegu praktycznie bez krwawień, nawet w przypadku miejsc mocno unaczynionych,
• zamrażanie może być powtarzane wielokrotnie lub planowane wieloetapowo.